高致病性呼吸道RNA病毒導致的感染，如流行性感冒與新型冠狀肺炎等，其疫情頻發且危害嚴重。I型干擾素（IFNs）是機體抵御病毒入侵的第一道防線，它通過激活固有免疫應答而保護宿主細胞免于病毒感染。

2020年4月7日，復旦大學生物醫學研究院/上海市公共衛生臨床中心徐建青與張曉燕教授聯合執導的研究團隊在Science子刊Science Signaling雜志上發表題為“IFN-κ suppresses the replication of influenza A viruses through the IFNAR-MAPK-Fos-CHD6 axis”的研究文章，并獲得當期特色文章的封面推介。

該研究通過不同致病性Influenza A virus (甲型流感病毒，IAV)感染的小鼠模型，發現流感病毒H9N2輕癥較H7N9重癥感染能更早地誘導I類IFN成員IFN-κ。與IFN-a和b通過STAT1抑制流感不同，IFN-κ通過IFN受體亞基IFNAR1和IFNAR2，激活MAPK通路進而上調cFos-CHD6通路而抑制流感病毒復制。該研究還發現IFN-κ預處理可保護小鼠預防流感病毒感染。上述研究結果提示，在疫情暴發時IFN-κ的免疫干預有望降低易感人群的罹患率，而且在病毒感染早期的干預可改善患者的臨床轉歸。

該團隊前期研究中發現，在人神經膠質瘤細胞中IFN-k可抑制寨卡病毒（ZIKV）復制，而ZIKV可通過AXL介導的STAT1/STAT2通路調節SOCS1表達進而下調I型 IFN信號轉導基因的激活和ISGs表達促進自身感染。但是單一基因突變的IFN-κ依然顯示抑制ZIKV復制效果，而突變型IFN-κ則顯著降低了抑制流感病毒的作用。提示IFN-κ抗ZIKV存在不同的作用機制，也許意味著對于不同的RNA病毒IFN-κ可能利用了不同的效應機制。未來的研究如能進一步解析IFN-κ抑制RNA病毒共性機制，必將為開發廣譜抗呼吸道RNA病毒藥物提供有力的科技支撐。

針對高致病性呼吸道疾病如流感，新冠肺炎等，TissueFAXS Cytometry技術具有極大的應用意義：

1 HE／IHC樣本組織：自動對簡單HE染色下肺組織中所有細胞輪廓進行識別，結合自動肺泡/支氣管的組織識別功能，迅速判斷炎性細胞數量、浸潤程度、上皮脫落面積、纖維化程度等指標。

2 IF樣本組織：結合標記特異性蛋白marker免疫組化或免疫熒光技術，可以進一步研究肺組織微環境中浸潤的免疫細胞表型、上皮細胞化生程度等實驗室精準定量指標。

3病毒原位研究：利用特異性核酸熒光探針以及免疫熒光技術，共同標記病毒相關蛋白的表面抗原及核酸核心，不但可以從圖像中精準定量病毒在細胞內外的數量及位置 — 建立通過肉眼可以判斷的病毒載量定量標準，同時分析病毒的增殖侵襲過程和組織的相互空間關系！

實驗方法

組織病理學和RNA原位雜交實驗利用TissueFAXS Confocal Plus 200系統，掃描5um厚的小鼠肺組織HE樣本和CHD6原位雜交樣本。 并通過StrataQuest軟件對獲取的圖像進行分析，可以在HE染色下通過形態學識別單個支氣管/肺泡腔體，精準定量支氣管數量、炎性細胞數量和炎性浸潤區域面積，然后對組織病理學進行評分。

IFN-κ預防小鼠甲型流感感染的組織學證據

（B）在感染后第1、2、3和7天（D1，D2，D3和D7）IFN-γ-Fc治療組和PBS治療組的HE染色肺組織圖像。

（C）IFN-κ-Fc和PBS治療組中肺組織中p-p38的IHC圖像及定量分析結果，可見在D1中，IFN-κ-Fc達到頂峰，以及在D0-D7中顯著高于PBS治療組。

（D）肺組織中CHD6 mRNA的原位雜交圖像及定量分析結果，可見在D1中RNA表達量達到頂峰，以及在D1-D7中顯著高于PBS治療組，與IHC在蛋白水平定量分析結果一致。